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生物方法评价污染物生物有效性可分为直接和间接两种。 其中，直接评价方法是指将生物体直接暴露于污染土壤中，待富集平衡后直接测定生物体内富集污染物的含量或微生物矿化的污染物的含量。 这种方法将土壤中生物因素（例如生物的新陈代谢）与非生物因素（如pH值、有机质含量）等影响生物有效的因素综合起来考虑，可以准确测定土壤中污染物对生物的有效性。
土壤中有机污染物生物有效性的评价方法主要包括化学方法和生物学方法两大类。 生物方法评价污染物生物有效性可分为直接和间接两种。 其中，直接评价方法是指将生物体直接暴露于污染土壤中，待富集平衡后直接测定生物体内富集污染物的含量或微生物矿化的污染物的含量。
有机污染物进入土壤后，必然发生吸附、解吸、迁移、转化等一系列物理、化学和生物学过程。 影响污染物生物有效性的主要因素有土壤物理化学性质、土壤生物种类、污染物的性质，及相互作用时间等环境因素。