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期刊论文是需要进行检测的，一般期刊文献会采用学术、维普、万方这三个论文查重系统中的一个进行论文查重，其他使用哪个论文查重系统，需要看出版机构的规定，不能盲目对查重系统进行使用。
学术参考文献一般不查重，而且论文的参考文献是一般是不需要查重的，而且学术检测系统时，就算把全部的论文上传上去，学术检测查重系统也是可以识别正确的目录和参考文献并剔除，不参与正文检测。 但是也千万不要图省钱，把参考文献哪些不参考查重的地方省略了。
简单来说，按照学校要求的大纲架构和参考文献引用规范（GB/T-7714）去写论文，学术都能识别出参考文献部分，并在查重时自动剔除。 不仅是参考文献部分，诸如论文封面、目录、成果清单等内容也是不在查重范围内的。 而且，在查重报告中， 不纳入查重范围的参考文献、目录等内容都会以灰色字体显示，而正文则以黑色字体显示。 通过这点，也可以帮助我们判断学术是否成功识别了参考文献等无需查重的内容。 那么，有人可能会说： 干脆在查重前把参考文献部分删除不就行了吗？ 如果你自己掏钱购买的查重服务，确实可以考虑这么做。 但是像我所在的浙江大学，学校为学生购买了学术查重服务，并集成到研究生管理系统了，而且， 用于查重的论文版本也是最终送审的版本 。
而且，在查重报告中， 不纳入查重范围的参考文献、目录等内容都会以灰色字体显示，而正文则以黑色字体显示。 通过这点，也可以帮助我们判断学术是否成功识别了参考文献等无需查重的内容。