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论文目录被查重标红了怎么办？
一般学校查重也是用的软件吧，除非您学校把每届学生的毕业论文全都收录下来，您要是不放心可以对一些词句进行替换就好了
首先，引用算不算抄袭，与标注出处没有任何关系，引用能不能检测出来，与系统准不准确也没有关系。所有这些都靠系统的阀值来决定。
中国知网对该套检测系统的灵敏度设置了一个阀值，该阀值为3%，以段落（或章节）的字数来计算，单篇文献低于3%的抄袭或引用是检测不出来的，这种情况常见于大段文字中的小句或者小概念。举个例子：假如检测段落1（第一章）有10000字，那么引用A文献300字（10000乘以3%=300）以内，是不会被检测出来的。若引用B文献超过300字，那么B文献分布于第一章中的抄袭都会被红字标注，不管位于第一章何处，即使打断成句子，只要超过20字就会被标注。[1]实际上这里也告诉同学们一个修改的方法，就是对段落抄袭千万不要选一篇文章来引用，尽可能多的选择多篇文献，一篇截取几句，这样是不会被检测出来的。[2]
关于一些同学问引用的为什么也算抄袭，这里主要是因为知网的阀值问题，高于3%的统一算抄袭，也就是说引用于抄袭的临界就在3%之间。一旦你超标，即使你标注了引用也无济于事。
[1] 这里所指的300字是一个大概值，并非临界值。引用的数量越低，就越不容易被检测出来。
[2] 更新以后的CNKI学术不端检测系统将这一阀值调整到了3%，以前是5%，意味着检测系统对引用的要求更加严格，但运用我们后面提到的方法也不是很难。
如果你的参考文献格式正确那么系统会自动识别并且剔除不参与正文查重。参考文献标红就说明你的格式有误。系统把你的参考文献当正文来对比查重了。希望可以帮到你，有问题随时追问我吧。
参考文献格式正确的话，那么会被中国知网论文查重系统识别和过滤。呈灰色字体，不参与论文查重中来。如果遇到知网查重里的参考文献标红的情况，那么原因不外乎两个：
1、使用了假的中国知网论文查重
如果使用了假的知网查重，那么自然无法对参考文献进行有效的识别。那么知网查重的参考文献被标红也就不足为奇了。在这里我们要学会验证真伪的方法。详情可以看知网查重宝典之前分享的文章《》。
2、参考文献的格式不正确
毕业论文的参考文献格式有误，造成中国知网无法甄别该一部分论文参考文献，当成文章注释内容对待，事实上，若该一部分参考文献式适当就会被知网检测甄别，从而不容易列入检测层面以内。一般来说按照学校的参考文献格式设置就没有问题。
如果学校没有给出格式要求，并且参考文献标红，那我们可以按照以下方法设置正确的文献格式：
1. 有明显的“参考文献”标记，参考文献4个字独占一行，下面是各个参考文献条目；
2. 每个参考文献有明显的标号，标号可以是以下任意一种：【Num】、[Num]、(Num)；
3. 标号可以是Word自动生成也可以手工书写；
4. 标号内不要添加标点符号，例如：不要[Num.]或(Num、)等；
5. 每个参考文献中最好有时间休息或者URL或《》书目信息；
6. 一条参考文献内及在此条参考文献没有结束时不要有手动换行或者回车符。
应该 是格式不正确，知网的算法会根据格式去判别是否属于参考文献的，另外参考考文献的格式尽量不要用工具生成啊