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申请保密的论文通常有两个方面，一是涉及专利保护，二是涉及国家机密或能源项目。 保密的侧重点在于不能上传，不做公开使用，但它首先得是一篇合格的论文，而查重是论文通过的第一关口。 所以，申请保密的论文也是要查重的，正规查重系统不会泄露你的论文细节和个人信息，放心吧。
参与保密的论文，通常是有一个保密周期，默认情况下是两年。 但是，两年之后，如果中国知网或者是自己所在学校，没有来申请公开，那么默认情况下也就不再进行知网检索收录。 所以，我们经常会发现，诸如清华、北大、国防科大等一些高精尖学科的毕业论文，在中国知网是检索不到的。 当然这部分涉及保密的论文，默认情况下也不作为知网查重的比对数据库内容。 但是，大家需要注意的一点是，某些高校或者某些高校所在的学院，如果本校毕业生涉密论文很多，那么这些学校会有“自建库”，即我们在知网查重系统数据库中见到的“个人比对库”，如下图1所示。
请问，申请保密的硕士毕业论文，会当做对比参与知网的查重吗？ 参与保密的论文，通常是有一个保密周期，默认情况下是两年。 但是，两年之后，如果中国知网或者是自己所在学校，没有来申请公开，那么默认情况下也就不再进行知网检索收录。 所以，我们经常会发现，诸如清华、北大、国防科大等一些高精尖学科的毕业论文，在中国知网是检索不到的。 当然这部分涉及保密的论文，默认情况下也不作为知网查重的比对数据库内容。 但是，大家需要注意的一点是，某些高校或者某些高校所在的学院，如果本校毕业生涉密论文很多，那么这些学校会有“自建库”，即我们在知网查重系统数据库中见到的“个人比对库”，如下图1所示。 高校的检测系统，后台老师是可以在“个人比对库”中添加涉密论文作为比对数据库内容的，如图2所示。
这是很多人疑惑的一个地方，毕竟参考文献太容易重复了。 答案是： 知网查重对象不包括参考文献，但你也不需要将参考文献从论文中删除。 以知网查重来说，可以肯定的是：查重对象是不包括参考文献的。 而且，就算你没有将参考文献从论文中删除，知网也是能正常识别出来参考文献部分的，前提是你的论文结构是规范的，而且按照 规范格式 引用了参考文献。 简单来说，按照学校要求的大纲架构和参考文献引用规范（GB/T-7714）去写论文，知网都能识别出参考文献部分，并在查重时自动剔除。 不仅是参考文献部分，诸如论文封面、目录、成果清单等内容也是不在查重范围内的。 而且，在查重报告中， 不纳入查重范围的参考文献、目录等内容都会以灰色字体显示，而正文则以黑色字体显示。